Não sendo muito extenso, o programa proposto é de elevada complexidade. Tal deve-se sobretudo à natureza irregular das geometrias presentes nos dois edifícios a reabilitar, bem como ao facto de os seus pavimentos apresentarem diferentes cotas e pés-direitos muito baixos, o que dificulta o estabelecer de atravessamentos e ligações horizontais. Em traços gerais, a três volumes construídos distintos, corresponderá uma valência: o alojamento (devidamente complementado pela taberna) ocupando os dois edifícios existentes (que efectivamente constituem um único volume); o museu no volume que corresponderá ao Lote 8 tal como definido no PPSVSM e na ampliação prevista no mesmo plano; o Restaurante no logradouro contíguo à Travessa de Sta. Maria, contido “entre muros”.

Procurou-se sobretudo que a distribuição e organização funcional dos espaços sublinhasse a diversidade espacial dos edifícios e logradouros existentes, proporcionando uma vivência rica, onde o factor surpresa convida a percorrê-los e a tirar partido das relações visuais com a paisagem urbana e natural. De destacar, neste aspecto, a manutenção de uma arcada que sustém um passadiço superior para espaço de logradouro contíguo à Travessa de Sta. Maria (que passará a ser local de esplanada na cobertura do Restaurante), ou a criação de uma varanda de canto a que se acede pela Sala de Exposição 6, no Piso 3 do Museu, da qual se obterá uma vista privilegiada para o torreão da Igreja do Espírito Santo e sobre a paisagem que se estende a perder de vista.